2011年4月25日，珠海大橫琴口岸建設開發有限公司在橫琴新區正式注冊成立。其后，為適應新區對口岸資產經營管理和承接跨境電商業務發展等需要，推動口岸公司由項目公司向口岸綜合開發運營商轉型發展，公司于2015年7月更名為珠海大橫琴口岸實業有限公司，注冊資本由500萬元增加至5億元。
隨著橫琴的開發建設及澳門的快速發展，國內外經橫琴口岸往來橫琴——澳門兩地的人數出現大幅度的增長，而原有的橫琴口岸建設標準較低、相關配套不完善無法滿足橫琴開發建設和遠期通關的需要，為促進橫琴、澳門兩地經濟建設和發展，橫琴新區于2010年啟動橫琴口岸建設前期工作。因橫琴口岸項目用地與原有口岸用地重合，因此將橫琴口岸及綜合交通樞細項目分兩期建設：一期工程橫琴過渡期口岸已于2014年12月建設并投入使用，實行24小時通關。二期工程即橫琴口岸主體項目于2016年12月份開工，項目將按照次性總體規劃、分期實施、自西向東推進有序建設，已于2020年8月18日實現橫琴口岸新旅檢區域的正式開通，2023年9月26日，橫琴口岸二期工程客貨車聯合一站式部分車道開通試運行。
橫琴口岸主體項目占地面積34.51萬平方米，建筑面積約131萬平方米（其中計容建筑面積8443萬平方米），投資總估算約為260億元。主要涵蓋三大功能體系: 口岸功能區、綜合交通樞紐功能區、口岸綜合開發：
1、口岸功能區：橫琴口岸的建設將在粵澳創新合作的基礎上，建設成為一個集客流、物流于體的“大通關”口岸。在橫琴口岸可實現創新旅檢通關模式，減少通關時間，大幅提升貨車通關速度，為大灣區流通暢保駕護航。
2、綜合交通樞紐功能區：強化交通樞紐設施建設，引入以公共交通、軌道交通為主導的交通疏解概念，建立立體化、多層面的交通體系。實現無縫換乘和便捷通關的同時，為整個口岸地區及橫琴片區提供良好的交通設施保障，交通設施可滿足旅客年通關量8000萬人次，日通關量22.2萬人次，日通關車輛8000輛次。
3、口岸綜合開發區：完善口岸配套服務設施，提升口岸整體服務品質，創新口岸與地塊開發聯合的運營機制，建設以粵澳臺作為背景、口岸為載體、自貿產業為先導、便捷交通為保障的新型口岸綜合開發項目。
在大橫琴集團公司“城市運營商+產業發展商”發展定位的指引下，口岸公司確立了兩大主業：一是橫琴口岸及配套設施投資、建設和運營管理，二是現代商貿物流產業和服務業，具體包括三大版塊：一是口岸建設與配套商業地產開發運營；二是口岸運維與資產經營；三是商貿物流配套和現代服務業經營。
自成立以來，大橫琴口岸公司緊緊圍繞兩大主業，全力推動橫琴口岸主體工程建設，培育口岸經濟和商業品牌，初步形成了以口岸建設為中心、以口岸運維為重點、以口岸商業資產經營、商貿物流、現代服務業為核心的業務發展格局。
